1987 年中山医科大学附属医院派出以梅骅教授为首的医疗专家团队，建立了内科、外科、骨科、肿瘤、妇科、儿科、中医、口腔、五官科等多学科的中山医科大学深圳医疗中心。医院于 1997 年将医疗中心升级为医院，并确立了以泌尿外科为重点发展方向的中山医科大学深圳泌尿外科医院。同年附属医院庄广伦教授带领其团队在医院创建了深圳市生殖医学中心，并于 1998 年在医院诞生了深圳市试管婴儿。2003 年医院改制，正式更名为深圳中山泌尿外科医院。